Muflihah Habiba Zahro adalah anak ke-1 dari Muhammad Muflih Romadhoni dan Ervica Badiatu Zahroh, yang merupakan anak ke-3 dari Faizah dan Sachro Yusuf, yang merupakan anak ke-4 dari Hj. Sofiyah dan H. Abdul Syakur Chairy, yang merupakan anak ke-3 dari Haji Basir dan Hj. Rodiah.